L’année suivante, l’Hôpital Général, dont la construction fut terminée en 1866, est réquisitionné pour l’armée et ce, jusqu’en 1870. Dans l’intervalle, les patients sont soignés dans l’hôpital en bois construit d’urgence, rue Water. Ce n’est qu’en 1871 que l’immeuble retourne à son usage premier.